CentOS5.5にMTOS-5.12-jaをインストールしたところ、動きませんでした。MTOS-5.04-ja の頃は「CentOS 64bit へのrpmforge追加、MTOS用Perl環境構築 | hiro345」のようにインストールしてあります。
原因を調べるため、mt-config.cgiをリネームして、mt-check.cgiを動かしてみました。どうやら、LibXMLのバージョンが古いため動かなくなってしまったようです。rpmforgeを使ってLibXMLはインストールしてあったのですが、とりあえずCPANから入れ直して回避しました。CPANからインストールするには、libxml2-develが必要だったので、それもインストールしました。
sudo yum install libxml2-devel
sudo perl -MCPAN -e 'CPAN::Shell->install("XML::LibXML")'
sudo perl -MCPAN -e 'CPAN::Shell->install("XML::LibXML")'