Eclipseのリファクタリング機能はどれくらいのものか、是非確認したいところ。
ただ、リファクタリングもむやみにやると、ぐちゃぐちゃになるので、方針をしっかり
もっていかないと。最低限、JUnitによるテストケース構築しておかなければいけない
ですね。

[連載]快適なXPドライビングのすすめ 第6回-Eclipseによるリファクタリングなんかも一応参考にはなりそうです。

だけどやっぱり、おかもとさんの記事がいいですかね。
連載 Eclipseを使おう！（1）オープンソースのEclipseは仕事に使える開発環境
[プロダクトレビュー]完成度を高め商用ツールの機能にさらに迫るEclipse 2.1
連載 Eclipse徹底活用！ 第1回　Eclipseからビルドツール「Ant」を使う

実は@ITは結構充実してますね。